常见问题
Frequently Asked Questions

推荐的最低蛋白起始量（按细胞 / 组织 / 液体样本分别说明）：

• 磷酸化（TiO₂ / IMAC）：细胞 ≥ 1 mg；组织 ≥ 5 mg；液体（血浆 / 脑脊液）≥ 5 mg
• 乙酰化 / 甲基化：细胞 ≥ 2 mg；组织 ≥ 10 mg
• 泛素化（K-ε-GG）：细胞 ≥ 3 mg；组织 ≥ 15 mg
• 乳酸化 / 巴豆酰化 / 琥珀酰化等低丰度酰化：细胞 ≥ 5 mg；组织 ≥ 20 mg
• 棕榈酰化（Acyl-RAC）：细胞 ≥ 2 mg
• 亚硝基化：细胞 ≥ 3 mg（生物素转换法对样本新鲜度敏感）

样本量不足时建议使用 FASP / S-Trap 微量方案，请提前与方案团队沟通。

• 细胞 / 组织样本：液氮速冻后 -80°C 保存，干冰运输（24h 内到达）
• 蛋白提取液：-80°C 保存，干冰运输；建议 SDS-PAGE 验证完整性
• 血液样本：EDTA 或肝素抗凝，4°C 2h 内分离血浆，-80°C 保存
• 运输建议：干冰 ≥ 5 kg / 24h 路程；Aimsmass 可提供全国主要城市上门取件服务

支持 FFPE 样本的修饰组学分析。但需要注意：

• FFPE 样本抗原决定簇侧链修饰可能影响抗体富集效率
• 推荐样本量 ≥ 10 张切片（10 μm 厚）
• 提供病理学 H&E 染色照片以辅助评估样本质量

典型时间线（从样本到交付）：

• 单组学小规模（≤ 6 样本）：3-4 周
• 单组学中等规模（7-30 样本）：4-6 周
• 多组学联合分析（如磷酸化 + 蛋白组）：6-8 周
• 大队列 + TMT 18 通道：8-12 周

急件通道：可缩短 30%-50%，额外加收 30% 急件费。

支持。标准交付分三阶段：

• 阶段一：原始质谱数据 + 数据库搜索结果（样本入库后 2 周）
• 阶段二：差异位点列表 + 基础统计图（+1 周）
• 阶段三：完整生信报告 + 可视化（+1-2 周）

• Label-free LFQ：样本数不限、组学深度高，适合探索性 / 大队列研究
• SILAC：仅限细胞培养，蛋白水平定量金标准
• TMT 16/18-plex：体外标记，多组（≤ 18）同时定量，组内 CV 极低
• DIA：循环时间固定、重现性高，适合回溯性分析

如不确定，可告知样本数与对比设计，方案团队会给出推荐组合。

使用 MaxQuant 的 Localization Probability (≥ 0.75 为高置信) 或 PTM-Score；DIA 数据使用 DIA-NN 的 site-level q-value (< 0.01)。所有位点均带 probability / score 列，可在 Excel 中筛选。

支持多修饰联合分析（如磷酸化 + 乙酰化、棕榈酰化 + 亚硝基化）。需要注意：

• 不同修饰的富集方法不同，需分别酶解 + 分别富集
• 样本量需求会按修饰数线性增加
• 推荐在方案设计阶段与生信团队讨论统计检验策略

所有原始质谱 RAW 文件、mzML、搜索结果与生信分析结果均归客户所有。Aimsmass 不保留任何使用权，亦不会将客户数据用于任何商业 / 学术二次发表。如客户同意，可在脱敏后作为方法学论文的示例数据引用。

• 提供符合期刊投稿规范的补充表格（Excel / CSV）
• 高质量 PDF 矢量图（火山图 / 热图 / Motif / 通路图）
• 原始质谱数据上传到 ProteomeXchange / PRIDE 的协助（部分期刊要求）
• 方法学描述模板（中英双语）
• 审稿人问题回复中的数据支持（2 轮免费）

客户可自行决定。Aimsmass 通常仅在致谢中提及（如 "感谢 Aimsmass 提供蛋白质组学检测服务"）。如需将 Aimsmass 生信 / 质谱工程师列为共同作者，须在项目启动时书面约定（项目开始后的作者署名调整需双方协商）。

报价由 4 部分组成：

• 样本制备与富集（按样本数 × 修饰类型）
• 质谱采集机时（按小时 / 针数）
• 生信分析（基础 / 高级 / 定制三档）
• 报告交付（标准 PDF / 扩展数据包）

学术用户（高校 / 科研院所）可申请 15%-25% 学术折扣。

支持 6% 现代服务业增值税专用发票 / 普通发票。发票抬头需与付款账户一致，开票周期 5-7 个工作日。